Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential
Nuno R. Faria(University of Oxford), Moritz U. G. Kraemer(Boston Children's Hospital), Sarah C. Hill(University of Oxford), Jaqueline Góes de Jesus(Fundação Oswaldo Cruz), Renato Santana Aguiar(Universidade Federal do Rio de Janeiro), Felipe Campos de Melo Iani(Universidade Federal de Minas Gerais), Joilson Xavier(Fundação Oswaldo Cruz), Josh Quick(University of Birmingham), Louis du Plessis(University of Oxford), Simon Dellicour(Rega Institute for Medical Research), Julien Thézé(University of Oxford), Rodrigo Dias de Oliveira Carvalho(Universidade Federal de Minas Gerais), Guy Baele(Rega Institute for Medical Research), Chieh‐Hsi Wu(University of Oxford), Paola Paz Silveira(Universidade Federal do Rio de Janeiro), Mônica Arruda(Universidade Federal do Rio de Janeiro), Mariza Pereira(Ezequiel Dias Foundation), G. C. Pereira(Ezequiel Dias Foundation), José Lourenço(University of Oxford), Uri Obolski(University of Oxford), Leandro Abade(University of Oxford), Tetyana I. Vasylyeva(University of Oxford), Marta Giovanetti(Universidade Federal de Minas Gerais), Dong‐Keun Yi(Harvard University), D. J. Weiss(University of Oxford), William Wint(University of Oxford), Freya M. Shearer(University of Oxford), Sebastian Funk(London School of Hygiene & Tropical Medicine), Birgit Nikolay(Centre National de la Recherche Scientifique), Vagner Fonseca(Universidade Federal de Minas Gerais), Talita Adelino(Ezequiel Dias Foundation), Marluce Aparecida Assunção Oliveira(Ezequiel Dias Foundation), M. V. F. Silva(Ezequiel Dias Foundation), Lívia Sacchetto(Universidade Federal de Minas Gerais), P. O. Figueiredo(Universidade Federal de Minas Gerais), Izabela Maurício de Rezende(Universidade Federal de Minas Gerais), Érica Munhoz de Mello(Universidade Federal de Minas Gerais), Rana Said(Universidade do Estado de Minas Gerais), D. A. Santos(Universidade do Estado de Minas Gerais), Marcela Lencine Ferraz(Universidade do Estado de Minas Gerais), Mariana Gontijo de Brito(Universidade do Estado de Minas Gerais), L. F. Santana(Universidade do Estado de Minas Gerais), Mariane Talon de Menezes(Universidade Federal do Rio de Janeiro), Rodrigo Brindeiro(Universidade Federal do Rio de Janeiro), Amílcar Tanuri(Universidade Federal do Rio de Janeiro), Fabiana Cristina Pereira dos Santos(Instituto Adolfo Lutz), Mariana Sequetin Cunha(Instituto Adolfo Lutz), Juliana Silva Nogueira(Instituto Adolfo Lutz), Iray Maria Rocco(Instituto Adolfo Lutz), Antônio Charlys da Costa(Universidade de São Paulo), Shirley Vasconcelos Komninakis(Faculdade de Medicina do ABC), Vasco Azevedo(Universidade Federal de Minas Gerais), Alexandre Chieppe(Universidade do Estado do Rio de Janeiro), Eliane Saraiva Machado de Araújo(Fundação Oswaldo Cruz), Marcos César Lima de Mendonça(Fundação Oswaldo Cruz), C. C. dos Santos(Fundação Oswaldo Cruz), Chagas Dos Santos(Fundação Oswaldo Cruz), A. M. Mares-Guia(Fundação Oswaldo Cruz), Rita Maria Ribeiro Nogueira(Fundação Oswaldo Cruz), Patrícia Carvalho de Sequeira(Fundação Oswaldo Cruz), Ricardo Gadelha de Abreu(Ministério da Saúde), M. H. O. Garcia(Ministério da Saúde), André Luiz de Abreu(Ministério da Saúde), Osnei Okumoto(Ministério da Saúde), Erna Geessien Kroon(Universidade Federal de Minas Gerais), Carlos F. Campelo de Albuquerque(Pan American Health Organization (Brasil)), Kuiama Lewandowski(Public Health England), Steven T. Pullan(Public Health England), Miles W. Carroll(University of Liverpool), Túlio de Oliveira(Centre for the AIDS Programme of Research in South Africa), Éster Cerdeira Sabino(Universidade de São Paulo), Renato Pereira de Souza(Instituto Adolfo Lutz), Marc A. Suchard(University of California, Los Angeles), Philippe Lemey(Rega Institute for Medical Research), G. S. Trindade(Universidade Federal de Minas Gerais), Betânia Paiva Drumond(Universidade Federal de Minas Gerais), Ana María Bispo de Filippis(Fundação Oswaldo Cruz), Nicholas J. Loman(University of Birmingham), Simon Cauchemez(Centre National de la Recherche Scientifique), Luíz Carlos Júnior Alcântara(Universidade Federal de Minas Gerais), Oliver G. Pybus(University of Oxford)
Cited by 385Open Access
Abstract
Arbovirus risk in Brazil Despite the existence of an effective vaccine for yellow fever, there are still almost 80,000 fatalities from this infection each year. Since 2016, there has been a resurgence of cases in Africa and South America—and this at a time when the vaccine is in short supply. The worry is that yellow fever will spread from the forests to the cities, because its vector, Aedes spp. mosquitoes, are globally ubiquitous. Faria et al. integrate genomic, epidemiological, and case distribution data from Brazil to estimate patterns of geographic spread, the risks of virus exposure, and the contributions of rural versus urban transmission (see the Perspective by Barrett). Currently, the yellow fever epidemic in Brazil seems to be driven by infections acquired while visiting forested areas and indicates spillover from susceptible wild primates. Science , this issue p. 894 ; see also p. 847
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