The neocortical microcircuit collaboration portal: a resource for rat somatosensory cortex
Srikanth Ramaswamy(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Jean-Denis Courcol(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Marwan Abdellah(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Stanisław Adaszewski(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Nicolas Antille(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Selim Arsever(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Guy Atenekeng(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Ahmet Bilgili(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Yury Brukau(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Athanassia Chalimourda(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Giuseppe Chindemi(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Fabien Delalondre(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Raphael Dumusc(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Stefan Eilemann(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Michael Gevaert(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Padraig Gleeson(University College London), Joe W. Graham(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Juan Hernando(Universidad Politécnica de Madrid), Lida Kanari(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Yury Nikolaevich Katkov(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Daniel Keller(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), James King(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Rajnish Ranjan(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Michael Reimann(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Christian Rössert(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Ying Shi(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Julian C. Shillcock(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Martin Telefont(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Werner Van Geit(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Jafet Villafranca Díaz(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Richard Walker(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Yun Wang(Genesys (United States)), Stefano M. Zaninetta(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Javier DeFelipe(Universidad Politécnica de Madrid), Sean Hill(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Jeffrey Muller(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Idan Segev(Hebrew University of Jerusalem), Felix Schürmann(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Eilif Müller(École Polytechnique Fédérale de Lausanne), Henry Markram(École Polytechnique Fédérale de Lausanne)
Cited by 186Open Access
Abstract
We have established a multi-constraint, data-driven process to digitally reconstruct, and simulate prototypical neocortical microcircuitry, using sparse experimental data. We applied this process to reconstruct the microcircuitry of the somatosensory cortex in juvenile rat at the cellular and synaptic levels. The resulting reconstruction is broadly consistent with current knowledge about the neocortical microcircuit and provides an array of predictions on its structure and function.
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